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PacBio三代测序平台的长读长及无需PCR扩增的技术优势，可进一步降低引入人为错误的可能性，克服部分微生物基因组GC含量高或重复序列多等问题，实现对微生物基因组进行更加详细的描绘因。

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MSAP可以检测不同样本基因组DNA甲基化的差异，通过不同限制酶识别甲基差异的特性来获得差异扩增片段的一种分子标记，是AFLP方法的延伸。

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